Kamu mali yönetiminin yapısını ve işleyişini düzenleyen 5018 sayılı Kamu Mali Yönetimi ve Kontrol Kanunu ile iç denetim ve iç denetçi kavramları kamu yönetimimize dahil edilmiştir. 5018 sayılı Kanunun 63. maddesinde iç denetim; kamu idaresinin çalışmalarına değer katmak ve geliştirmek için kaynakların ekonomiklik, etkililik ve verimlilik esaslarına göre yönetilip yönetilmediğini değerlendirmek ve rehberlik yapmak amacıyla yapılan bağımsız, nesnel güvence sağlama ve danışmanlık faaliyeti olarak tanımlanmaktadır.
Bu çerçevede 5018 sayılı Kanunun 63. maddesi gereği kurumumuzda iç denetim faaliyetleri 2017 yılında başlamış olup, 2019 yılında İç Denetim Birimi kurulmuştur. İç Denetim Birimi, 2 iç denetçi ile doğrudan Üst Yöneticiye bağlı olmakla birlikte Hazine ve Maliye Bakanlığı İç Denetim Koordinasyon Kurulunun denetimi ve gözetiminde faaliyetlerini yürütmektedir.
İç denetim faaliyetleri, Kurumumuzda 5018 sayılı Kamu Mali Yönetimi ve Kontrol Kanunu, bu Kanuna bağlı olarak çıkartılan İç Denetçilerin Çalışma Usul ve Esasları Hakkında Yönetmelik esas olmak üzere İç Denetim Koordinasyon Kurulu (İDKK) tarafından hazırlanıp yürürlüğe giren Kamu İç Denetim Standartları, Kamu İç Denetim Rehberi, Kamu İç Denetim Genel Tebliği ve diğer düzenlemeler ile Kurumumuz İç Denetim Yönergesi hükümleri doğrultusunda yürütülmektedir.
İç Denetim Biriminin görevleri aşağıdaki gibidir.
İç Denetim Birimi olarak vizyonumuz; mesleki etik değerlere, ulusal ve uluslararası standartlara uygun olarak sürekli kendini yenileyen ve kurum faaliyetlerine değer katan bir yaklaşımla denetim faaliyetleri sunmaktır.